G:/Supplementary material for PM6-ORG/Compare PM6-ORG and PDB protein geometries/Compare (all) Sodium

Compare "Sodium channel pore (4CBC) PM6-ORG geometry.arc" and "Sodium channel pore (4CBC) PDB geometry.arc"

Toggle display
1&2 1 2 		Toggle center picture
Console Fit to screen
Near Neighbors Connected Neighbors
Common Script   (Read file from:
"common.txt")
Specific Script   (Read file from:
"Compare (all) Sodium.txt")

Toggle Individual Residues

G
130

V
131

G
132

S
133

V
134

A
135

A
136

L
137

L
138

T
139

V
140

V
141

F
142

Y
143

I
144

A
145

A
146

V
147

M
148

A
149

T
150

N
151

L
152

Y
153

G
154

A
155

T
156

F
157

P
158

E
159

W
160

F
161

G
162

D
163

L
164

S
165

K
166

S
167

L
168

Y
169

T
170

L
171

F
172

Q
173

V
174

M
175

T
176

L
177

E
178

S
179

W
180

S
181

M
182

G
183

I
184

V
185

R
186

P
187

V
188

M
189

N
190

V
191

H
192

P
193

N
194

A
195

W
196

V
197

F
198

F
199

I
200

P
201

F
202

I
203

M
204

L
205

T
206

T
207

F
208

T
209

V
210

L
211

N
212

L
213

F
214

I
215

G
216

I
217

I
218

V
219

D
220

A
221

M
222

G
130

V
131

G
132

S
133

V
134

A
135

A
136

L
137

L
138

T
139

V
140

V
141

F
142

Y
143

I
144

A
145

A
146

V
147

M
148

A
149

T
150

N
151

L
152

Y
153

G
154

A
155

T
156

F
157

P
158

E
159

W
160

F
161

G
162

D
163

L
164

S
165

K
166

S
167

L
168

Y
169

T
170

L
171

F
172

Q
173

V
174

M
175

T
176

L
177

E
178

S
179

W
180

S
181

M
182

G
183

I
184

V
185

R
186

P
187

V
188

M
189

N
190

V
191

H
192

P
193

N
194

A
195

W
196

V
197

F
198

F
199

I
200

P
201

F
202

I
203

M
204

L
205

T
206

T
207

F
208

T
209

V
210

L
211

N
212

L
213

F
214

I
215

G
216

I
217

I
218

V
219

D
220

A
221

M
222

G
130

V
131

G
132

S
133

V
134

A
135

A
136

L
137

L
138

T
139

V
140

V
141

F
142

Y
143

I
144

A
145

A
146

V
147

M
148

A
149

T
150

N
151

L
152

Y
153

G
154

A
155

T
156

F
157

P
158

E
159

W
160

F
161

G
162

D
163

L
164

S
165

K
166

S
167

L
168

Y
169

T
170

L
171

F
172

Q
173

V
174

M
175

T
176

L
177

E
178

S
179

W
180

S
181

M
182

G
183

I
184

V
185

R
186

P
187

V
188

M
189

N
190

V
191

H
192

P
193

N
194

A
195

W
196

V
197

F
198

F
199

I
200

P
201

F
202

I
203

M
204

L
205

T
206

T
207

F
208

T
209

V
210

L
211

N
212

L
213

F
214

I
215

G
216

I
217

I
218

V
219

D
220

A
221

M
222

G
130

V
131

G
132

S
133

V
134

A
135

A
136

L
137

L
138

T
139

V
140

V
141

F
142

Y
143

I
144

A
145

A
146

V
147

M
148

A
149

T
150

N
151

L
152

Y
153

G
154

A
155

T
156

F
157

P
158

E
159

W
160

F
161

G
162

D
163

L
164

S
165

K
166

S
167

L
168

Y
169

T
170

L
171

F
172

Q
173

V
174

M
175

T
176

L
177

E
178

S
179

W
180

S
181

M
182

G
183

I
184

V
185

R
186

P
187

V
188

M
189

N
190

V
191

H
192

P
193

N
194

A
195

W
196

V
197

F
198

F
199

I
200

P
201

F
202

I
203

M
204

L
205

T
206

T
207

F
208

T
209

V
210

L
211

N
212

L
213

F
214

I
215

G
216

I
217

I
218

V
219

D
220

A
221

M
222

X
1201

X
1201

X
1201

X
1301

X
1302

X
1303

X
1201

Date:     Jul 12 2023 10:02
No. atoms:      6345
Formula:     C2028H3264N432O594S24Na3
GEO_DAT:      -35341.092 kcal/mol
GEO_REF:      -32229.873 kcal/mol
RMSD: 1.390Å Diff: 7679.970Å